В статье рассматриваются системные правовые проблемы лицензирования медицинской деятельности в Российской Федерации. Целью исследования является выявление ключевых дефектов действующей модели лицензирования и разработка на этой основе конкретных предложений по ее совершенствованию. Для достижения цели решаются задачи по анализу нормативной базы, классификации проблем, изучению судебной практики. Научная новизна заключается в обосновании комплексного подхода к реформе, ключевыми элементами которого являются: переход к риск-ориентированной модели, полная цифровизация процедур («электронное лицензионное дело») и разработка специализированных требований для услуг с использованием телемедицинских технологий. Результаты исследования могут быть использованы в законотворческой деятельности для совершенствования законодательства о лицензировании, а также в практической работе контрольно-надзорных органов и медицинских организаций. В результате проведенного исследования правового регулирования лицензирования медицинской деятельности, установлено, что несмотря на свою значимость с точки зрения обеспечения охраны здоровья граждан, существуют определенные пробелы, связанные с фрагментарностью и избыточностью требований, установленных при проведении лицензирования медицинской деятельности. Внесены предложения по реформированию данного института, реализация которых позволит достичь баланса между необходимым уровнем государственного контроля и созданием благоприятных условий для развития медицинского предпринимательства и инноваций.